Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Rtf1A2AQ19 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rtf1A2AQ19 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rtf1A2AQ19 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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