Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb1A2AQ07 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubb1A2AQ07 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms