Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1aA2APX8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms