Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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