Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll9A2APC3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll9A2APC3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms