Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Fam43bA2AM80 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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