Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc183A2AJB1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc183A2AJB1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms