Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ambra1A2AH22 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ambra1A2AH22 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms