Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms