Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RNP2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms