Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Speer3W4VSP1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Speer3W4VSP1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Speer3W4VSP1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Speer3W4VSP1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer3W4VSP1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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