Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms