Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17190V9GX38 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms