Protein–RNA interactions for Protein: S4R2P9

Slc8a3, Sodium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a3S4R2P9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a3S4R2P9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms