Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3839S4R1W1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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