Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms