Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Krt27Q9Z320 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Krt27Q9Z320 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Krt27Q9Z320 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Krt27Q9Z320 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Krt27Q9Z320 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Krt27Q9Z320 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms