Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vamp5Q9Z2P8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms