Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt16Q9Z2K1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms