Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms