Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd1Q9Z2E2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms