Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RfxankQ9Z205 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms