Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3b1Q9Z1T1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b1Q9Z1T1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms