Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lgr5Q9Z1P4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms