Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nup160Q9Z0W3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup160Q9Z0W3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms