Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PapolbQ9WVP6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms