Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Apobec2Q9WV35 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec2Q9WV35 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms