Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnni1Q9WUZ5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms