Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NbnQ9R207 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms