Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn7Q9R1S8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms