Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubd1Q9R1K7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms