Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfwd2Q9R1A8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms