Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed2Q9R0Q3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms