Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav3Q9R0C8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav3Q9R0C8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms