Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Col4a3Q9QZS0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Col4a3Q9QZS0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Col4a3Q9QZS0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Col4a3Q9QZS0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Col4a3Q9QZS0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Col4a3Q9QZS0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a3Q9QZS0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms