Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a4Q9QZR9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms