Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc4Q9QZD4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms