Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms