Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt3Q9QZ47 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms