Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vnn3Q9QZ25 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vnn3Q9QZ25 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms