Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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