Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nufip1Q9QXX8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms