Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcsk1nQ9QXV0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms