Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lsm4Q9QXA5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms