Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc5Q9QX29 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms