Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt1Q9JMD1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms