Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp1Q9JLK7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cabp1Q9JLK7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms