Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn15Q9JLG8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Capn15Q9JLG8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn15Q9JLG8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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