Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gde1Q9JL56 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gde1Q9JL56 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gde1Q9JL56 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gde1Q9JL56 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
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Gde1Q9JL56 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gde1Q9JL56 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gde1Q9JL56 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gde1Q9JL56 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gde1Q9JL56 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gde1Q9JL56 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gde1Q9JL56 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gde1Q9JL56 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gde1Q9JL56 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms