Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk3aQ9JKX8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk3aQ9JKX8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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